RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 COL10A1Q03692 680 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 OCLNQ16625 522 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 HCP5Q6MZN7 132 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 POC1AQ8NBT0 407 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5M11Q96RB7 305 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 USE1Q9NZ43 259 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF222Q9UK12 451 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 R4GMQ9 66 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1-204ENST00000459646 G3V2T6 193 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 J3QT63 122 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 DLGAP1O14490 977 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SYT7O43581 403 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 APOL3O95236 402 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SERPINA3P01011 423 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 TK1P04183 234 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 OCM2P0CE71 109 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 PGA5P0DJD9 388 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ROM1Q03395 351 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 EDDM3AQ14507 147 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF273Q14593 569 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SSX2Q16385 188 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM219Q86XT9 240 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 DTX3Q8N9I9 347 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ITFG2Q969R8 447 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SLAMF9Q96A28 289 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 NRBF2Q96F24 287 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 POMPQ9Y244 141 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0G2JK05 382 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A1B0GTI1 187 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 G3V4G9 280 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BUI4 141 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CYB5AP00167 134 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CHRM2P08172 466 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CALCBP10092 127 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 GABRR1P24046 479 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 EFNB2P52799 333 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 OR12D2P58182 307 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC34A1Q06495 639 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CALHM1Q8IU99 346 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 NDNFQ8TB73 568 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM163Q8TC26 289 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 BORCS8Q96FH0 119 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP19Q96LK0 163 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 MNTQ99583 582 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CLN6Q9NWW5 311 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 V9GYS6 101 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 METTL15A6NJ78 407 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 K7N7A8 449 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 F2RL2O00254 374 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CHST1O43916 411 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXO24O75426 580 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF728P0DKX0 622 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 FASP25445 335 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 DUSP1P28562 367 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 EPHA2P29317 976 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 POU3F4P49335 361 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 FUT6P51993 359 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP1B3P54709 279 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SCN1BQ07699 218 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 FAHD1Q6P587 224 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf88Q6PI97 169 aa6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms