RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBL3O95164 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RENP00797 406 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV3-15P01624 115 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV1-44P01699 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLPIP03973 132 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTM3P21266 225 aa7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF774Q6NX45 483 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.05□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLE4Q9NR33 117 aa7.05□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYAAP02489 173 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPR2P20594 1047 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MSR1P21757 451 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARR3P36575 388 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NR4A2P43354 598 aa7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVS71-1P61550 626 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSG4Q00888 419 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSF2Q03933 536 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC36A2Q495M3 483 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARCH7Q9H992 704 aa7.04□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CENPMQ9NSP4 180 aa7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.04□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.03□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THRSPQ92748 146 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR76Q9H967 626 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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