RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 MAGEA2P43356 314 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 MAGEA3P43357 314 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 AKR1C2P52895 323 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 AKR1C1Q04828 323 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 SMARCB1Q12824 385 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 PDE6HQ13956 83 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 NCF4Q15080 339 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 STX1AQ16623 288 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 MEP1BQ16820 701 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 ODF2Q5BJF6 829 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 LRIF1Q5T3J3 769 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC30Q5VVM6 783 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 PRSS54Q6PEW0 395 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 APOA5Q6Q788 366 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CASC1Q6TDU7 716 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 SPINT4Q6UDR6 99 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 MAEAQ7L5Y9 396 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 DPY19L4Q7Z388 723 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TRIM69Q86WT6 500 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TDRPQ86YL5 185 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 IQCF2Q8IXL9 164 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 NME8Q8N427 588 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CARNMT1Q8N4J0 409 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF680Q8NEM1 530 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR2M7Q8NG81 312 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR8B12Q8NGG6 310 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR52E4Q8NGH9 312 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR9G4Q8NGQ1 327 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR1L1Q8NH94 360 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 ETNPPLQ8TBG4 499 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 URGCPQ8TCY9 931 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CD300LFQ8TDQ1 290 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CHURC1Q8WUH1 139 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 SCFD1Q8WVM8 642 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 GTF3C6Q969F1 213 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 UBE2E3Q969T4 207 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TBC1D20Q96BZ9 403 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 ELP4Q96EB1 424 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CAPZA3Q96KX2 299 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 SIGMAR1Q99720 223 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 AGPAT1Q99943 283 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 UQCC2Q9BRT2 126 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TIMM21Q9BVV7 248 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TSSK6Q9BXA6 273 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 LRRC27Q9C0I9 530 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CTDSP1Q9GZU7 261 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM117Q9H0C3 514 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 C20orf85Q9H1P6 137 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 GANQ9H2C0 597 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 ETNK2Q9NVF9 386 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 FANCLQ9NW38 375 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 DOK5Q9P104 306 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TXNDC16Q9P2K2 825 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 DNAJC12Q9UKB3 198 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 OR1A2Q9Y585 309 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD57-201ENST00000448188 TRAV6A0A075B6T7 132 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1B0GTI1 187 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ISPDA4D126 451 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ERICH4A6NGS2 130 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 C4orf51C9J302 202 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 I3L521 148 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 NDC80O14777 642 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 FFAR1O14842 300 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 PGRMC2O15173 223 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 NME2P1O60361 137 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 TIMM17BO60830 172 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 BBOX1O75936 387 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 MYO1DO94832 1006 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 METTL18O95568 372 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SERPINA3P01011 423 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 GH1P01241 217 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV3-25P01717 112 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV3-27P01718 113 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 SLC4A1P02730 911 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 IL4P05112 153 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD57-201ENST00000448188 CT62P0C5K7 136 aa-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms