RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 UFD1Q92890 307 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CHIAQ9BZP6 476 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 GPR84Q9NQS5 396 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 R4GMQ9 66 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 BTBD17A6NE02 478 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ACOD1A6NK06 481 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MAP2K3P46734 347 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R43P59537 309 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 FGF12P61328 243 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CEP78Q5JTW2 689 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 METTL11BQ5VVY1 283 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 Q8TCH9 128 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 A0A0U1RQV5 110 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ZNF879B4DU55 563 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CCRL2O00421 344 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA2O43678 99 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CLPXO76031 633 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TOX4O94842 621 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TTRP02766 147 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MELTFP08582 738 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CPEP16870 476 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 FAHP16930 419 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CELP19835 753 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DCTDP32321 178 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 BDH1Q02338 343 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ACSM1Q08AH1 577 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CDK5R1Q15078 307 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SSX1Q16384 188 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 FBLN7Q53RD9 439 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 WDR38Q5JTN6 314 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MOB3CQ70IA8 216 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 WDR86Q86TI4 376 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 LRRC29Q8WV35 223 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ITPKCQ96DU7 683 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 RNF170Q96K19 258 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TECTBQ96PL2 329 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GVI7 797 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DPPA5A6NC42 116 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OOEPA6NGQ2 149 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 A6NIN4 97 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 LGALS8O00214 317 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CDIPTO14735 213 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 OGG1O15527 345 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DHRS3O75911 302 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ALX3O95076 343 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CST4P01036 141 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 GYPAP02724 150 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CD36P16671 472 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TGFBR2P37173 567 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 KIR3DL2P43630 455 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TGM4P49221 684 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 GPM6AP51674 278 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TPBGQ13641 420 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 GPR107Q5VW38 600 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms