RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA4P78363 2273 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GX78 115 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 A6NLC8 198 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CDS2O95674 445 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DAOP14920 347 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCR1P25024 350 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3CQ96E17 227 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RASL10BQ96S79 203 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOTQ9UBF9 498 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NCKAP5O14513 1909 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JRQ6 117 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HEXBP07686 556 aa3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 RAB5AP20339 215 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 VAMP1P23763 118 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CDAP32320 146 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1A1P48729 337 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX7Q7RTT5 188 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 POM121Q96HA1 1249 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PCOLCEQ15113 449 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GGNQ86UU5 652 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PP6455Q8WZ26 134 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM54Q969K7 222 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL11Q969Q4 196 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX3Q99909 188 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRY4Q9C004 299 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 UPB1Q9UBR1 384 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GHRLQ9UBU3 117 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMA5O15230 3695 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRK2Q5S007 2527 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf72A6NCS6 295 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF724A8MTY0 619 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C2Y5 167 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PMP2P02689 132 aa3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NSDHLQ15738 373 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ACER2Q5QJU3 275 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DNLZQ5SXM8 178 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 MICU1Q9BPX6 476 aa3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 PLSCR2Q9NRY7 297 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF732B4DXR9 585 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SCGNO76038 276 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 UMODP07911 640 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HCKP08631 526 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZRG5 221 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A7Q92504 469 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51M1Q9H341 326 aa3.13□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B6O14756 317 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TAAR5O14804 337 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BKO60814 126 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS3O75911 302 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BJP06899 126 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5H8P0DN80 308 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BOP23527 126 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DTYMKP23919 212 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BBP33778 126 aa3.12□□□□□ -1.91
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