RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 HMGN4O00479 90 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OPN1SWP03999 348 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 IFNW1P05000 195 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC159P0C7I6 412 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 OR4A16Q8NH70 328 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TBK1Q9UHD2 729 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 G3V2L1 256 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 GPR50Q13585 617 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 OR8B8Q15620 311 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZR03 302 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.63□□□□□ -1.83
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PTPRK-210ENST00000415055 NFE4Q86UQ8 179 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM54Q969K7 222 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 CMBLQ96DG6 245 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 EPYCQ99645 322 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 TPPP3Q9BW30 176 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-210ENST00000415055 SIRPDQ9H106 197 aa3.63□□□□□ -1.83
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