RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410238.1

RNU6-257P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 257, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-257P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-257P-201ENST00000410238 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZNF737O75373 536 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 FLOT1O75955 427 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SMC2O95347 1197 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 GTF2F2P13984 249 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SSR1P43307 286 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ACLYP53396 1101 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 RAB11AP62491 216 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SP4Q02446 784 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HTR4Q13639 388 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 LINC00303Q3SY05 128 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SPINK9Q5DT21 86 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PPM1LQ5SGD2 360 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 KDM4DQ6B0I6 523 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CCDC121Q6ZUS5 278 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZNF555Q8NEP9 628 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CPB2Q96IY4 423 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PRRT1Q99946 306 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 THAP9Q9H5L6 903 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PSMD13Q9UNM6 376 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ENPP4Q9Y6X5 453 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CACNA1AO00555 2505 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 UBN2Q6ZU65 1347 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 A6NDN8 102 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TMEM50AO95807 157 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 OR4Q2P0C623 313 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HLA-GP17693 338 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CCND2P30279 289 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 MYCNOSP40205 109 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 RPL14P50914 215 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZNF90Q03938 601 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 REEP3Q6NUK4 255 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SPC24Q8NBT2 197 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 APH1AQ96BI3 265 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CMTM5Q96DZ9 223 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ADTRPQ96IZ2 230 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ATP6V0BQ99437 205 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TAPBPLQ9BX59 468 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PXMP2Q9NR77 195 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HEBP1Q9NRV9 189 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 UPK2O00526 184 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 AQP8O94778 261 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 GPR75O95800 540 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SOD3P08294 240 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PGA5P0DJD9 388 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 FOXN2P32314 431 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CBX1P83916 185 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZNF117Q03924 483 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TGFBIQ15582 683 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 GLYATQ6IB77 296 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 MBOAT7Q96N66 472 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SLC39A3Q9BRY0 314 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HRASLS2Q9NWW9 162 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TMEM131Q92545 1883 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HPRT1P00492 218 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 GUSBP08236 651 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PGA4P0DJD7 388 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 PGA3P0DJD8 388 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 FAM229BQ4G0N7 80 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TMEM155Q4W5P6 130 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TTMPQ5BVD1 217 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CENPPQ6IPU0 288 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CBLN2Q8IUK8 224 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 C1orf158Q8N1D5 194 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SLC35F6Q8N357 371 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 OR1S1Q8NH92 325 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 ASB17Q8WXJ9 295 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 FAM131CQ96AQ9 280 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 CCDC126Q96EE4 140 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 AMELYQ99218 206 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 TMEM70Q9BUB7 260 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 JCADQ9P266 1359 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 UNC79Q9P2D8 2635 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 AKNAQ7Z591 1439 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-257P-201ENST00000410238 HSPG2P98160 4391 aa-1.66□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms