RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ALDOBP05062 364 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 RPS2P15880 293 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 GP2P55259 537 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 FAM27D1Q5T7N8 215 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ACP7Q6ZNF0 438 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM91Q6ZNR0 172 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CEACAM19Q7Z692 300 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 OR5D18Q8NGL1 313 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TMIGD2Q96BF3 282 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 RASL12Q9NYN1 266 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 FOXJ3Q9UPW0 622 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 DOCK11Q5JSL3 2073 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 B4DSR2 109 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 MAGEB3O15480 346 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFA2O43678 99 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 PSMB9P28065 219 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 BDKRB2P30411 391 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 GABRA5P31644 462 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TRAM1Q15629 374 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 STUMQ69YW2 141 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 MKXQ8IYA7 352 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CEP19Q96LK0 163 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 LPAR2Q9HBW0 351 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 HES4Q9HCC6 221 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NLKQ9UBE8 527 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CTSZQ9UBR2 303 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 AMY2BP19961 511 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ZP1P60852 638 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFB11Q9NX14 153 aa25.1■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 MTORP42345 2549 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ANGPTL7O43827 346 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TGFAP01135 160 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NEDD8Q15843 81 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 Q71RC1 249 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 SATL1Q86VE3 508 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 LURAP1LQ8IV03 231 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 OR51F2Q8NH61 342 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ANGPTL6Q8NI99 470 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 OR2AT4A6NND4 320 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ADAM20O43506 726 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NXPH2O95156 264 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1D-12P01611 117 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TFF1P04155 84 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CPT2P23786 658 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NPBWR2P48146 333 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 FABP5Q01469 135 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 DDI2Q5TDH0 399 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF841Q6ZN19 808 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CCL13Q99616 98 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 KAAG1Q9UBP8 84 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 SVEP1Q4LDE5 3571 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 MSMBP08118 114 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 PSG2P11465 335 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SMIM21Q3B7S5 101 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 NLRC3Q7RTR2 1065 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 OR8B3Q8NGG8 313 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 OR8B2Q96RD0 313 aa25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GW55 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 CCRL2O00421 344 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 GABRPO00591 440 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 TMPRSS2O15393 492 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 CYB5AP00167 134 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 MAS1P04201 325 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 UCHL1P09936 223 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L2P0CJ85 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L3P0CJ86 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L4P0CJ87 422 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L5P0CJ88 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L6P0CJ89 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L7P0CJ90 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 BCL3P20749 454 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 GPER1Q99527 375 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 DUX4Q9UBX2 424 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF222Q9UK12 451 aa25.06■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 FCN3O75636 299 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM225BP0DP42 221 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 PITPNBP48739 271 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 LCN2P80188 198 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 ESCO2Q56NI9 601 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 C1QL2Q7Z5L3 287 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 SAXO1Q8IYX7 474 aa25.05■■□□□ 1.6
PKDCC-202ENST00000401498 MUL1Q969V5 352 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms