RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF144BQ7Z419 303 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 C1QL2Q7Z5L3 287 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM106AQ96A25 262 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 OPALINQ96PE5 141 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MMP26Q9NRE1 261 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SNTG1Q9NSN8 517 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CTSZQ9UBR2 303 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.59■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 J3QLI3 93 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SULT1B1O43704 296 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CD2P06729 351 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MTCP1P56278 107 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CRIP3Q6Q6R5 217 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 OR8B3Q8NGG8 313 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 OR8B2Q96RD0 313 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TAS2R4Q9NYW5 299 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJB11Q9UBS4 358 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.58■■□□□ 1.21
GNPTAB-202ENST00000392919 A8MXK9 166 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAM20O43506 726 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXH1O75593 365 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 AMY2BP19961 511 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 Q499Y3 187 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ESCO2Q56NI9 601 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 STUMQ69YW2 141 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 OR5T2Q8NGG2 359 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SPACA5Q96QH8 159 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.57■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PLATP00750 562 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PITPNBP48739 271 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ERVK11-1P61568 191 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 OR51A2Q8NGJ7 313 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ORAI1Q96D31 301 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 CCL13Q99616 98 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ISYNA1Q9NPH2 558 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 RASL12Q9NYN1 266 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 MTCH1Q9NZJ7 389 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NLKQ9UBE8 527 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 KAAG1Q9UBP8 84 aa22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A0A6YYJ9 748 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1B0GW55 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 FCN3O75636 299 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB3AP20336 220 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 GATA3P23771 443 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ACP7Q6ZNF0 438 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC25A26Q70HW3 274 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 BATF2Q8N1L9 274 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 RFT1Q96AA3 541 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 OR14A2Q96R54 314 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 HES4Q9HCC6 221 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DUX4Q9UBX2 424 aa22.55■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 FSHBP01225 129 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TFF1P04155 84 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 HSMCR30P0CW71 290 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 POU3F4P49335 361 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 GNB2P62879 340 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SCGB2A2Q13296 93 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR50Q13585 617 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TPBGQ13641 420 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TEX29Q8N6K0 151 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NANPQ8TBE9 248 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SLAMF9Q96A28 289 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NEK6Q9HC98 313 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC42Q9Y546 428 aa22.54■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 OR2AT4A6NND4 320 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF879B4DU55 563 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 F8VVB4 439 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 F8VWA3 439 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TMPRSS2O15393 492 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 HCKP08631 526 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PSG2P11465 335 aa22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PDZK1IP1Q13113 114 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms