RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 NCKAP5O14513 1909 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 IGHEP01854 428 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF32P17041 273 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 RPL12P30050 165 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 AAED1Q7RTV5 226 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF716A6NP11 495 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 CHATP28329 748 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM42Q69YG0 159 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 GGNQ86UU5 652 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SDK2Q58EX2 2172 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 K7EPK0 472 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 MASP2O00187 686 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 DEDDO75618 318 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 CST4P01036 141 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 NRASP01111 189 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 FCGR3AP08637 254 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 NTF4P34130 210 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 HTR5AP47898 357 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SEC11CQ9BY50 192 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 LRP3O75074 770 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 RRADP55042 308 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 AKR7LQ8NHP1 331 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 HRH4Q9H3N8 390 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0G2JMM0 328 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PPB8 328 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PRS3 328 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 KIR3DP1A8MWS1 328 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 H2AFB1P0C5Y9 115 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF728P0DKX0 622 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 B4GALT1P15291 398 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PRRX2Q99811 253 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SULT4A1Q9BR01 284 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 RGCCQ9H4X1 137 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 BCO1Q9HAY6 547 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 OPRM1P35372 400 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PIGPP57054 158 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SPEM2Q0P670 501 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 OR2A2Q6IF42 318 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SPAG16Q8N0X2 631 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 LIME1Q9H400 295 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL13O43927 109 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SNAPINO95295 136 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PRKACAP17612 351 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SULT1A2P50226 295 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 CAV2P51636 162 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PSG4Q00888 419 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00518Q8N0U6 118 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 OSR2Q8N2R0 312 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 FOXB1Q99853 325 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 RHOFQ9HBH0 211 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 IL36GQ9NZH8 169 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 JTBO76095 146 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 FCGR2CP31995 323 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PCBD1P61457 104 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ABCA11PQ4W5N1 156 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM268Q5VZI3 342 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 OR2H1Q9GZK4 316 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 NAA60Q9H7X0 242 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 MED6O75586 246 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 OR2V1Q8NHB1 315 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 TOMM40LQ969M1 308 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 WNT5BQ9H1J7 359 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHA2Q9HB19 425 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 SLC7A11Q9UPY5 501 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 PATE4P0C8F1 98 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 FUT6P51993 359 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 GALNT14Q96FL9 552 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 FBXL17Q9UF56 701 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF175Q9Y473 711 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD13-201ENST00000392539 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms