RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF24P17028 368 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB5AP20339 215 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP6V1C1P21283 382 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 USF1P22415 310 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL3RAP26951 378 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNTFRP26992 372 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEAD1P28347 426 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC1A1P43005 524 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPICP45877 212 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 EMP1P54849 157 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2B6P58173 313 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTPNP58546 118 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACTR3P61158 418 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC38A11Q08AI6 406 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TFDP2Q14188 446 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDK3Q15120 406 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 INAQ16352 499 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAJINQ3KP22 176 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C6orf99Q4VX62 202 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC183Q5T5S1 534 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM27D1Q5T7N8 215 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 REEP3Q6NUK4 255 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 KDELC1Q6UW63 502 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 UGT2A3Q6UWM9 527 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RUFY3Q7L099 469 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRINAQ7Z429 371 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERASQ7Z444 233 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 UNC93AQ86WB7 457 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MS4A15Q8N5U1 240 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C11orf72Q8NBR9 251 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPR26Q8NDV2 337 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR1L6Q8NGR2 347 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM57AQ8TBR7 257 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C16orf78Q8WTQ4 265 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTP4A1Q93096 173 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 S100PBPQ96BU1 408 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C10orf35Q96D05 121 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RCN3Q96D15 328 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CMBLQ96DG6 245 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAMD8Q96LT4 415 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q96M85 177 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RDH12Q96NR8 316 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM111AQ96PZ2 611 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 AMELYQ99218 206 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MGLLQ99685 303 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TPPP3Q9BW30 176 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD60Q9BZ19 345 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARL6Q9H0F7 186 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARV1Q9H2C2 271 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 VCX2Q9H322 139 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMDT1Q9H4I9 107 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD19PQ9H560 264 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRORYQ9H606 182 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 VCX3AQ9NNX9 186 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLE4Q9NR33 117 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PXMP2Q9NR77 195 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SDHAF3Q9NRP4 125 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEBP1Q9NRV9 189 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNIP2Q9NS61 270 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 TREX1Q9NSU2 369 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 VAX2Q9UIW0 290 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 NUDCQ9Y266 331 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEY1Q9Y5J3 304 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALG5Q9Y673 324 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 C2orf16Q68DN1 1984 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELP1O95163 1332 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 VWA8A3KMH1 1905 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATG2BQ96BY7 2078 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 FN1P02751 2386 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 DISP1Q96F81 1524 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GVG6 124 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms