RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 MAS1LP35410 378 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 ZXDBP98169 803 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 SPEM2Q0P670 501 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 KIRREL2Q6UWL6 708 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 BTNL8Q6UX41 500 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 CLECL1Q8IZS7 167 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 GBGT1Q8N5D6 347 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 OR4D9Q8NGE8 314 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 SERTAD4Q9NUC0 356 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 NAT8Q9UHE5 227 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 M0QYG6 137 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 TNFSF15O95150 251 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 PPP1CBP62140 327 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 ZNF479Q96JC4 524 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 GUCD1Q96NT3 240 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 TRIB3Q96RU7 358 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
CTIF-202ENST00000382998 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 FAM221AA4D161 298 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SPINT1O43278 529 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 FGF17O60258 216 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 DEDDO75618 318 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 OR2T7P0C7T2 308 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PPOXP50336 477 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ZNF74Q16587 644 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 MFRPQ9BY79 579 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 INPP5EQ9NRR6 644 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 S1PR2O95136 353 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 DDAH2O95865 285 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GRB2P62993 217 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 MDGA2Q7Z553 956 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ZNF101Q8IZC7 436 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 RAB37Q96AX2 223 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ANGPTL4Q9BY76 406 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 DEFB126Q9BYW3 111 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 C1orf198Q9H425 327 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PLXNB2O15031 1838 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 CCL25O15444 150 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GDF9O60383 454 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 NNATQ16517 81 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 TMEM128Q5BJH2 165 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZSR9 355 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 RNF175Q8N4F7 328 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 STARD5Q9NSY2 213 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 THYN1Q9P016 225 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 CDIPTO14735 213 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 HPNP05981 417 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ZNF17P17021 662 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 KITLGP21583 273 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GPM6AP51674 278 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SGCBQ16585 318 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 C1orf210Q8IVY1 113 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SLAMF6Q96DU3 332 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 RNF122Q9H9V4 155 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ELOVL5Q9NYP7 299 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 FBXW9Q5XUX1 488 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 THEM6Q8WUY1 208 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 THAP4Q8WY91 577 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 FGF22Q9HCT0 170 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ENPP4Q9Y6X5 453 aa12.26□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 XRCC2O43543 280 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 ZNF205O95201 554 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 NUDT3O95989 172 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 MPC1LP0DKB6 136 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GABRG2P18507 467 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SULF2Q8IWU5 870 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 TMEM100Q9NV29 134 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 FXYD1O00168 92 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 LANCL1O43813 399 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SOD1P00441 154 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GABRA3P34903 492 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PPP2CBP62714 309 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 PPP2CAP67775 309 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 LTBQ06643 244 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GAGE5Q13069 117 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 GAGE6Q13070 117 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CTIF-202ENST00000382998 VWA2Q5GFL6 755 aa12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 248.7 ms