RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDZK1IP1Q13113 114 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFNB3Q15768 340 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MUC15Q8N387 334 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELMOD3Q96FG2 381 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GHRLQ9UBU3 117 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0A6YYH2 397 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 A6NJ64 397 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANGPTL7O43827 346 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM76BQ5HYJ3 339 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF611Q8N823 705 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPERTQ8NA61 448 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52I2Q8NH67 350 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNG3Q8TAE7 436 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCAMRQ8WWV6 532 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXW5Q969U6 566 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51I2Q9H344 312 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCA4P78363 2273 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 B9A039 149 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRPP07492 148 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF154Q13106 437 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF573Q86YE8 665 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM104Q8NE00 496 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 M0R233 179 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 LYRM1O43325 122 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDC14BO60729 498 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGHV1-46P01743 117 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SRP9P49458 86 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MOGAT2Q3SYC2 334 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC22A6Q4U2R8 563 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A26Q70HW3 274 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL14Q8N1E6 418 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOMM5Q8N4H5 51 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 S100A13Q99584 98 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPIG6BO95866 241 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 GDNFP39905 211 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPRNQ5BIV9 151 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MZT2BQ6NZ67 158 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEDD4LQ96PU5 975 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 BANF2Q9H503 90 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEIOCA2RUB1 952 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRP5LA4QPB2 252 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM210A6NLX4 147 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 HS3ST1O14792 307 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ORC5O43913 435 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV1D-12P01611 117 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SWI5Q1ZZU3 235 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB12Q6IQ22 244 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCCPDHQ8NBX0 429 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10K1Q8NGX5 313 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51F2Q8NH61 342 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CST11Q9H112 138 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A1W2PP11 408 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 C17orf100A8MU93 164 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNGR1O43759 233 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2V2Q96R30 315 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM59Q9BXS4 323 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 LPAR5Q9H1C0 372 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKDREJQ9NTG1 2253 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM221AA4D161 298 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB27BO00194 218 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD200P41217 278 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPPED2Q15777 294 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNM1P46Q6ZS02 220 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 BATF2Q8N1L9 274 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 DYNLRB1Q9NP97 96 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK11Q9UBX7 282 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDIPTO14735 213 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHBDL1O75783 438 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCGNO76038 276 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 VEGFCP49767 419 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MZT1Q08AG7 82 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASCL4Q6XD76 172 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 PXT1Q8NFP0 134 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 AQP3Q92482 292 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLAMF9Q96A28 289 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 NICN1Q9BSH3 213 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 UFSP2Q9NUQ7 469 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNG2Q9Y698 323 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOSR1O95249 250 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINA2P20848 420 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR176Q14439 515 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSU1Q15404 277 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 C11orf53Q8IXP5 236 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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