RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 CD79AP11912 226 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-DOBP13765 273 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NBL1P41271 181 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GSK3BP49841 420 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HCCSP53701 268 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR2B8PP59922 312 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2KP61086 200 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HES1Q14469 280 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PEA15Q15121 130 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 EBPQ15125 230 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MPPED2Q15777 294 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TP53I3Q53FA7 332 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SYPL2Q5VXT5 272 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 STUMQ69YW2 141 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HACD2Q6Y1H2 254 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CMC1Q7Z7K0 106 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LRTM2Q8N967 370 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GPR32P1Q8NGA4 272 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR2T27Q8NH04 317 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF563Q8TA94 476 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HGDQ93099 445 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TCEAL3Q969E4 200 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NEURL2Q9BR09 285 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IL25Q9H293 177 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LRMDAQ9H2I8 198 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MIOSQ9NXC5 875 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DOK5Q9P104 306 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC2DQ9UHP7 191 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO5Q9UKT4 447 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PLLPQ9Y342 182 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MED12Q93074 2177 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LRP4O75096 1905 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 M0R143 59 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 M0R2Z0 102 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCRL2O00421 344 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ORC5O43913 435 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 COX7A2P2O60397 106 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ALOX12BO75342 701 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CTDNEP1O95476 244 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A27O95847 323 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MAS1P04201 325 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FABP3P05413 133 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FBP1P09467 338 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINA2P20848 420 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CA6P23280 308 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IL3RAP26951 378 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AK4P27144 223 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HPCAL1P37235 193 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MMP12P39900 470 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AMTP48728 403 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCL23P55773 120 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CLDN17P56750 224 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RHOBP62745 196 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DEFA5Q01523 94 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DHODHQ02127 395 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF616Q08AN1 781 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CEACAM7Q14002 265 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GNMTQ14749 295 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP1Q6P2D0 407 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PNCKQ6P2M8 343 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ARPINQ7Z6K5 226 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF547Q8IVP9 402 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PDZD9Q8IXQ8 264 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35G3Q8N808 338 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR4E2Q8NGC2 313 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR10A7Q8NGE5 316 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR10K1Q8NGX5 313 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR56B4Q8NH76 319 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SCGB1C1Q8TD33 95 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SMPDL3AQ92484 453 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 YIPF5Q969M3 257 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MOCOSQ96EN8 888 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IL12RB2Q99665 862 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms