RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MNDAP41218 407 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPC3P51654 580 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC35A1P78382 337 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAE1Q13564 534 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PON2Q15165 354 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ORMDL2Q53FV1 153 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CT83Q5H943 113 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PHYHD1Q5SRE7 291 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 XAF1Q6GPH4 301 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 H3F3CQ6NXT2 135 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MZT2BQ6NZ67 158 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AMTNQ6UX39 209 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PEX5LQ8IYB4 626 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NECAB1Q8N987 351 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR8B3Q8NGG8 313 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ING5Q8WYH8 240 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EID2BQ96D98 161 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MTERF3Q96E29 417 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAAR9Q96RI9 348 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OMDQ99983 421 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC39A3Q9BRY0 314 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FICDQ9BVA6 458 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BBS2Q9BXC9 721 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC25A2Q9BXI2 301 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STK31Q9BXU1 1019 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 B3GNT5Q9BYG0 378 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SIL1Q9H173 461 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DEFB127Q9H1M4 99 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MEAF6Q9HAF1 191 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRAK4Q9NWZ3 460 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STK39Q9UEW8 545 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLA2G4CQ9UP65 541 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PSME4Q14997 1843 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0D9SEW6 157 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLEKHD1A6NEE1 506 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM235A6NFC5 223 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 K7ERS5 55 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AGPAT2O15120 278 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ASNA1O43681 348 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TYROBPO43914 113 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HMMRO75330 724 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IDH1O75874 414 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV3-33P01772 117 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAS1P04201 325 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UGT2B4P06133 528 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM236CP0DP71 79 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POU2F1P14859 743 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPL17P18621 184 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLRA2P23416 452 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CETN2P41208 172 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAP1BP61224 184 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POSTNQ15063 836 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC15A2Q16348 729 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BATFQ16520 125 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UGT8Q16880 541 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1orf137Q5JT78 98 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GCNT6Q5T4J0 391 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MZT2AQ6P582 158 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPGNQ6UW88 154 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXW12Q6X9E4 464 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLRX5Q86SX6 157 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ORMDL3Q8N138 153 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MPP5Q8N3R9 675 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MREGQ8N565 214 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARL10Q8N8L6 244 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR4M1Q8NGD0 313 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR1N2Q8NGR9 330 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR51H1Q8NH63 302 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR148Q8TDV2 347 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC107Q8WV48 283 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC138Q96M89 665 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR7D2Q96RA2 312 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAT9Q9BTE0 207 aa-3.1□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms