RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGCCQ9H4X1 137 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 VSIRQ9H7M9 311 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RDH14Q9HBH5 336 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM60AQ9NP50 221 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2S2Q9NQN1 319 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBG2Q9NRH3 451 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB23Q9ULC3 237 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENPP4Q9Y6X5 453 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELP1O95163 1332 aa1.09□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBN3Q75N90 2809 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3QT63 122 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFS5O43920 106 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTTG1O95997 202 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSR1P21757 451 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAX6P26367 422 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IVDP26440 423 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFHR2P36980 270 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEX19P40855 299 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLF1P58340 268 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL5RAQ01344 420 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST3GAL4Q11206 333 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDNFQ49AH0 187 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00523Q86TU6 105 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5T3Q8NGG3 340 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4D6Q8NGJ1 314 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6K6Q8NGW6 343 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM57AQ8TBR7 257 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCP10LQ8TDR4 215 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF170Q96K19 258 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 DERL3Q96Q80 235 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf50Q9HD87 102 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFL2Q9Y281 166 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C2Y5 167 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 UPK1AO00322 258 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAPPC6AO75865 159 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHMP01871 453 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5AL1P0C617 328 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC11BP0C7V7 166 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRMP19623 302 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEAD1P28347 426 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNRHRP30968 328 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT2P50583 147 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXA1P55317 472 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R60P59551 318 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMC5P62195 406 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35B1P78383 322 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOC2AQ14183 400 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC32Q5I0X7 151 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD16Q68DU8 428 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZS52 159 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMPPEQ6ZT21 453 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCF24Q7RTU0 167 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 VTCN1Q7Z7D3 282 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPRIPQ8IWB1 547 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC22Q8N966 263 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO36Q8NEA4 188 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5H2Q8NGV7 314 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPACA5Q96QH8 159 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP3A43Q9HB55 503 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCB9Q9NP78 766 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRO0628Q9UI54 55 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFR2Q9UP52 801 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 MROH5Q6ZUA9 1318 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf16Q68DN1 1984 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEURL4Q96JN8 1562 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMNCA6NCL1 334 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLL5B9A064 214 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9JQL5 133 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 OVOL1O14753 267 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATCO43716 136 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHA8P1O95397 391 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETHE1O95571 254 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf1O96002 111 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFI30P13284 250 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKACAP17612 351 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPS1L1P21108 318 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A1P30531 599 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTR2BP41595 481 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUFMP49411 452 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCAP31P51572 246 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMVKQ15126 192 aa1.06□□□□□ -2.24
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms