RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 WDR1O75083 606 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CA11O75493 328 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 OR4E1P0C645 316 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 BCL3P20749 454 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 SNU13P55769 128 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 PPP1CBP62140 327 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CDK10Q15131 360 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.052e-17■■■■□ 23
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ACTB-201ENST00000331789 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.35■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 FTMTQ8N4E7 242 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 SPICQ8N5J4 248 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 OR5A2Q8NGI9 324 aa15.35■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.35■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 AK3Q9UIJ7 227 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ACACAQ13085 2346 aa15.35■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 AKR7A2O43488 359 aa15.34■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.34■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CCDC107Q8WV48 283 aa15.34■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 BOD1Q96IK1 185 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 HSF4Q9ULV5 492 aa15.34■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 F8VVB4 439 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 F8VWA3 439 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 K7ENP7 123 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CA6P23280 308 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 PPA1Q15181 289 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZMYND11Q15326 602 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ACTBL2Q562R1 376 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 HYLS1Q96M11 299 aa15.33■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 FN3KRPQ9HA64 309 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.33■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 LAMA5O15230 3695 aa15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 PIPOXQ9P0Z9 390 aa15.33■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 J3QW42 95 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 SYNGR1O43759 233 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 SIX6O95475 246 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3-15P01624 115 aa15.32■□□□□ 0.04
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ACTB-201ENST00000331789 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 OR1J1Q8NGS3 322 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.32■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 IL2RAP01589 272 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 OR3A3P47888 321 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 TSPAN5P62079 268 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 P2RY6Q15077 328 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 BEND4Q6ZU67 534 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 Q8NA96 180 aa15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
ACTB-201ENST00000331789 Q8NFD4 153 aa15.31■□□□□ 0.04
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