RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LOXP28300 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TATDN3Q17R31 274 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM104Q8NE00 496 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP37Q8NFH4 326 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEH1LQ96EE3 360 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TECTBQ96PL2 329 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.35■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0B4J293 547 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LPLP06858 475 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSF1P09603 554 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF250P15622 560 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTCP1P56278 107 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q6ZR03 302 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AQP3Q92482 292 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CST11Q9H112 138 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSL2Q9HCI7 577 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KITLGP21583 273 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VEGFCP49767 419 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFP69Q49AA0 526 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH24Q86UP0 819 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHST4Q8NCG5 386 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10R2Q8NGX6 335 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.34■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLATP00750 562 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD3EP07766 207 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCR6P51684 374 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BEX5Q5H9J7 111 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 S100A13Q99584 98 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BANF2Q9H503 90 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC7A11Q9UPY5 501 aa20.33■□□□□ 0.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ROS1P08922 2347 aa20.33■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 E7EQL1 145 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6V1G1O75348 118 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MELTFP08582 738 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGFBP2P18065 325 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBG1P23258 451 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBP2P50120 134 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPM6AP51674 278 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FUT6P51993 359 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACTBP60709 375 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACTG1P63261 375 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDNFQ49AH0 187 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR8G5Q8NG78 346 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10AD1Q8NGE0 317 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BORCS8Q96FH0 119 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF170Q96K19 258 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MLNRO43193 412 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB25P57735 213 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZP1P60852 638 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADIPOQQ15848 244 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1orf174Q8IYL3 243 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUDT15Q9NV35 164 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALG5Q9Y673 324 aa20.32■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SELEP16581 610 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q6ZTK2 550 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FTMTQ8N4E7 242 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5P3Q8WZ94 311 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NICN1Q9BSH3 213 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SELENOIQ9C0D9 397 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.31■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A0A6YYD4 124 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1W2PP11 408 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM235A6NFC5 223 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHFRP00374 187 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGHV3-13P01766 116 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM225BP0DP42 221 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLA2G2AP14555 144 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAG2P55895 527 aa20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS23P62266 143 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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