RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 INHBBP09529 407 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 RGS13O14921 159 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC10Q5BKY1 277 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR13G1Q8NGZ3 307 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB3O43676 98 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR10V1Q8NGI7 309 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FAM96BQ9Y3D0 163 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD1Q15116 288 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PAX6P26367 422 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 LPAR6P43657 344 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MICBQ29980 383 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FFAR4Q5NUL3 377 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR5B21A6NL26 309 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 VSTM2LQ96N03 204 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 WNT16Q9UBV4 365 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR10D3Q8NH80 312 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FAM60AQ9NP50 221 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL17Q9UF56 701 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 POU2F2P09086 479 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 GALNSP34059 522 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NXPH1P58417 271 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 IRF3Q14653 427 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM241Q24JQ0 296 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T6Q8NHC8 308 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CA6P23280 308 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDD2Q6NTF9 364 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF66Q6ZN08 573 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FLRT3Q9NZU0 649 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SPRY3O43610 288 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 COL9A1P20849 921 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PSG6Q00889 435 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR5I1Q13606 314 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NPEPL1Q8NDH3 523 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FCER1GP30273 86 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 KRTDAPP60985 99 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF766Q5HY98 468 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 STUMQ69YW2 141 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB123Q8N688 67 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D11Q8NGI4 311 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AC1P0C628 307 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 RAB7AP51149 207 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM92Q6UXU6 159 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ASB10Q8WXI3 467 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FAM3AP98173 230 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ICAM5Q9UMF0 924 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SCN1AP35498 2009 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR5H15A6NDH6 313 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FAM24AA6NFZ4 105 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ASCL1P50553 236 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LSM6P62312 80 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SSPNQ14714 243 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1FQ16864 119 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MIXL1Q9H2W2 232 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG5Q9UF02 275 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MPZL1O95297 269 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MESTQ5EB52 335 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PTP4A1Q93096 173 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SARGQ9BW04 601 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SLC45A2Q9UMX9 530 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MPC1Q9Y5U8 109 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 GVQW1Q8N7I0 195 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 NHLRC2Q8NBF2 726 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf35Q96D05 121 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 J3QR89 54 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 VASH2Q86V25 355 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PECRQ9BY49 303 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FRRS1LQ9P0K9 344 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 RAC3P60763 192 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 RPS4Y2Q8TD47 263 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 IER2Q9BTL4 223 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SMCHD1A6NHR9 2005 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR3BO75015 233 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FGF2P09038 288 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PAX5Q02548 391 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 IL24Q13007 206 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 IFT22Q9H7X7 185 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms