RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 EML5Q05BV3 1969 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ESPL1Q14674 2120 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TNFRSF10CO14798 259 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF264O43296 627 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NXPH3O95157 252 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TLE1Q04724 770 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 KIR2DS3Q14952 304 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM123Q8N131 208 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GPR119Q8TDV5 335 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LTBP2Q14767 1821 aa9.56□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 C17orf105B2RV13 164 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BKO60814 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TIAF1O95411 115 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BJP06899 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CXCL1P09341 107 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35E2P0CK97 266 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BOP23527 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HSD11B1P28845 292 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BBP33778 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BDP58876 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BCP62807 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 DLK1P80370 383 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NHLH2Q02577 135 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RNF144BQ7Z419 303 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HAS2Q92819 552 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CACNA1DQ01668 2161 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GLB1P16278 677 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 BATFQ16520 125 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM156Q8N614 296 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR1L3Q8NH93 324 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 Q8WTZ3 238 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 EMC6Q9BV81 110 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 OR10A5Q9H207 317 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 R4GMQ9 66 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CENPEQ02224 2701 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 WIPF3A6NGB9 483 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 IFITM10A6NMD0 228 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNHIT1O43257 154 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TRAPPC6AO75865 159 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TNFSF15O95150 251 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MBP02144 154 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HSD11B2P80365 405 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 FAM166AQ6J272 317 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HEPN1Q6WQI6 88 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF429Q86V71 674 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CA13Q8N1Q1 262 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HSF4Q9ULV5 492 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PLXNA2O75051 1894 aa9.55□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1W2PQM1 296 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CYR61O00622 381 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TRGC1P0CF51 173 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 GABRR1P24046 479 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CAPZBP47756 277 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC6A9P48067 706 aa9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 EGR4Q05215 589 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms