RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ZNF124Q15973 351 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C11orf94C9JXX5 98 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 F11P03951 625 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 HTR1DP28221 377 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 KISS1Q15726 138 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.33□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 PEX11BO96011 259 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 HLA-DQB1P01920 261 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1456Q9P272 454 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 RRADP55042 308 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C21orf58P58505 322 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 IGLV3-27P01718 113 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 YPEL5P62699 121 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ACER2Q5QJU3 275 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ST8SIA1Q92185 356 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 FUT6P51993 359 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 SPSB1Q96BD6 273 aa14.32□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.32□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 FAM87AP0C7U9 286 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 B4GALNT1Q00973 533 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 GAMTQ14353 236 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ACSM6Q6P461 480 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C10orf111Q8N326 155 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SNURFLB1AK76 121 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SSR4P51571 173 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CLDN15P56746 228 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TEX30Q5JUR7 227 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR5AS1Q8N127 324 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ACY3Q96HD9 319 aa14.31□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 PGA5P0DJD9 388 aa14.31□□□□□ -0.12
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CTIF-201ENST00000256413 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CLDN23Q96B33 292 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ASB16Q96NS5 453 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OXGR1Q96P68 337 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 VSIG4Q9Y279 399 aa14.31□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 G3V3Y1 287 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 KCNAB3O43448 404 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ARID1AO14497 2285 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR2J3O76001 311 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CHRNB4P30926 498 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 Q56UQ5 140 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZG16BQ96DA0 208 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CD1CP29017 333 aa14.3□□□□□ -0.12
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