RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MYCNOSP40205 109 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ECI1P42126 302 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A1P53007 311 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TEX30Q5JUR7 227 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 FAM185AQ8N0U4 392 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 AQP11Q8NBQ7 271 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ISOC1Q96CN7 298 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 MED30Q96HR3 178 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ15Q99712 375 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 OPA3Q9H6K4 179 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ORC6Q9Y5N6 252 aa13.04□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ODF3BA8MYP8 253 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 G3V2T6 193 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 RHBDL1O75783 438 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SSX2Q16385 188 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS45Q7RTY3 260 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00471Q8N535 108 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T29Q8NH02 315 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 MALSU1Q96EH3 234 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 SLC29A1Q99808 456 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TSSK6Q9BXA6 273 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 TLNRD1Q9H1K6 362 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 CENPMQ9NSP4 180 aa13.03□□□□□ -0.32
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 J3QL48 77 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 XRCC2O43543 280 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CCNB2O95067 398 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FMO3P31513 532 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ERVFRD-1P60508 538 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GMFBP60983 142 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FAM3AP98173 230 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL12Q53G59 568 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZMAT4Q9H898 229 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 REEP1Q9H902 201 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 BATF3Q9NR55 127 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 LRP12Q9Y561 859 aa13.02□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FAM90A22PA8MWA6 464 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 EI24O14681 340 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CDIPTO14735 213 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 LPLP06858 475 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A1P30531 599 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CX3CR1P49238 355 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH3A2P51648 485 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OSR2Q8N2R0 312 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 DHRSXQ8N5I4 330 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T33Q8NG76 320 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR8S1Q8NH09 359 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CNBD2Q96M20 576 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RDH12Q96NR8 316 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 AMELYQ99218 206 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CMC2Q9NRP2 79 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF319Q9P2F9 582 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SCOCQ9UIL1 159 aa13.01□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 DDOSTP39656 456 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 VEGFCP49767 419 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GRB2P62993 217 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf66Q5T8R8 295 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNRF1Q8ND25 227 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR6N2Q8NGY6 317 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 NRBF2Q96F24 287 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 MED20Q9H944 212 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 U3KQV3 271 aa13□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FAM183AA6NL82 134 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TBX1O43435 398 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ARG1P05089 322 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF3P17036 446 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GK3PQ14409 553 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TAF13Q15543 124 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 MICAQ29983 383 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF626Q68DY1 528 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms