RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.03	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP9	O43315	295 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF749	O43361	778 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT14	O95848	222 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	FABP3	P05413	133 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CTSE	P14091	401 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKACG	P22612	351 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GSS	P48637	474 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CCR8	P51685	355 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DHODH	Q02127	395 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RGN	Q15493	299 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	EPYC	Q99645	322 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.03	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GTH9	108 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT2B11	O75310	529 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NXPH4	O95158	308 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	AHSA1	O95433	338 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT75	O95678	551 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTL6A	O96019	429 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA14	P01570	189 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL3	P20749	454 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINB1	P30740	379 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CEACAM3	P40198	252 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGEA2	P43356	314 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MFAP2	P55001	183 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00205	P59089	165 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IL18R1	Q13478	541 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DOHH	Q9BU89	302 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.02	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	REEP1	Q9H902	201 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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