RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635776.1

SCN1A-210, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCN1A, Length 10,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-210ENST00000635776 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 GABRA6Q16445 453 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 STX12Q86Y82 276 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 BANF2Q9H503 90 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 CALHM2Q9HA72 323 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 G3V3Y1 287 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 IFNA1P01562 189 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 MAGEB1P43366 347 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 RAB1AP62820 205 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 TOMM40LQ969M1 308 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 MARC2Q969Z3 335 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 RAB39BQ96DA2 213 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 PRR32B1ATL7 298 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 SNAPINO95295 136 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 GPANK1O95872 356 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 LIPCP11150 499 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 CXCL3P19876 107 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 GNRHRP30968 328 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 CALCRP30988 508 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 SERPINF1P36955 418 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 LPAL2Q16609 132 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF75AQ96N20 296 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 GPR31O00270 319 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 MPC2O95563 127 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 HBE1P02100 147 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 RAC2P15153 192 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 NPY4RP50391 375 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF774Q6NX45 483 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 Q6ZSR3 168 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF708P17019 499 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 ZNF766Q5HY98 468 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 LINC00696Q6ZRV3 163 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 RELTQ969Z4 430 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 KLK13Q9UKR3 277 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 U3KQA8 63 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 NME2P1O60361 137 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 PRH1P02810 166 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 NME2P22392 152 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 DEGS1O15121 323 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ROBO4Q8WZ75 1007 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.99□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 SHOXO15266 292 aa3.98□□□□□ -1.77
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SCN1A-210ENST00000635776 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.98□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 HYAL4Q2M3T9 481 aa3.98□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.98□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.98□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SCN1A-210ENST00000635776 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
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