RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CD83Q01151 205 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 POC1AQ8NBT0 407 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPAL2Q9H841 368 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5B21A6NL26 309 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PQ18 207 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-11P60412 298 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC34A1Q06495 639 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 BATF2Q8N1L9 274 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5A2Q8NGI9 324 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF3BA8MYP8 253 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SELENOFO60613 162 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NXPH2O95156 264 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIC3O95833 236 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGA2P52926 109 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF454Q8N9F8 522 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOSQ8NHW6 89 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HILPDAQ9Y5L2 63 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TENM3Q9P273 2699 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BUI4 141 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B1P14061 328 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF626Q68DY1 528 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT77Q7Z794 578 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CALHM1Q8IU99 346 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCF1Q8N6M8 205 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 DPF1Q92782 380 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 GSC2O15499 205 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 TK1P04183 234 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NDNFQ8TB73 568 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf98A8MV24 154 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SASH3O75995 380 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HAAOP46952 286 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 EDDM3BP56851 147 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LCN8Q6JVE9 175 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPSLQ8WWF8 208 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BN98 237 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QT63 122 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PGA5P0DJD9 388 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF728P0DKX0 622 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNLT3P51808 116 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DLX6P56179 175 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF684Q5T5D7 378 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11H6Q8NGC7 330 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4X2Q8NGF9 303 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MYDGFQ969H8 173 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8B4Q96RC9 309 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 B9D2Q9BPU9 175 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGLQ9Y2B2 252 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 U3KQV3 271 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH9Q9NYC9 4486 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDX6P30041 224 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF573Q86YE8 665 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP5EQ9NRR6 644 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ENPP5Q9UJA9 477 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RQV5 110 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1-8P0DP01 117 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1B1P15313 513 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PLBD1Q6P4A8 553 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51E1Q8TCB6 317 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CDRT15Q96T59 188 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMP5Q9UJQ1 280 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 COL7A1Q02388 2944 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 NRASP01111 189 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS7P62081 194 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CBX1P83916 185 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MICAQ29983 383 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2R1Q6VVX0 501 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR61Q9BZJ8 451 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR84Q9NQS5 396 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A13Q9Y226 551 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD9O00233 223 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 RBP4P02753 201 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTA2P62736 377 aa21.91■■□□□ 1.1
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