RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 HFEQ30201 348 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CDH24Q86UP0 819 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 BATF2Q8N1L9 274 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 NINJ1Q92982 152 aa7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 J3QT63 122 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 GMFBP60983 142 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 WDR82Q6UXN9 313 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 Q8TCH9 128 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC29Q8WV35 223 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 YIPF5Q969M3 257 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLAMF9Q96A28 289 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RNF7Q9UBF6 113 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 V9GY05 133 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 H3BMQ9 156 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 MPZP25189 248 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 PSMD7P51665 324 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 USP43Q70EL4 1123 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-211ENST00000626236 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF525Q8N782 197 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR51F2Q8NH61 342 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MBD6Q96DN6 1003 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CEP19Q96LK0 163 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 S100A13Q99584 98 aa7.17□□□□□ -1.26
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