RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCL2P13500 99 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF250P15622 560 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TALDO1P37837 337 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 BMXP51813 675 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ERVS71-1P61550 626 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIST1H3AP68431 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RELBQ01201 579 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 DERL3Q96Q80 235 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR51B6Q9H340 312 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NEK6Q9HC98 313 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NOX4Q9NPH5 578 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MEGF11A6BM72 1044 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR6C6A6NF89 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RER1O15258 196 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NGFP01138 241 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SELEP16581 610 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD40LGP29965 261 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIR3DL2P43630 455 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC6A9P48067 706 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CX3CR1P49238 355 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLP2Q04941 152 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 COMMD2Q86X83 199 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM106AQ96A25 262 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PGAM5Q96HS1 289 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1RLQ9NZP8 487 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYT7O43581 403 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 DOK2O60496 412 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SERPINA5P05154 406 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRYBA1P05813 215 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SOX2P48431 317 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRKXP51817 358 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAPZA1P52907 286 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TAF9Q16594 264 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IDNKQ5T6J7 187 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 DRAM2Q6UX65 266 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ITFG2Q969R8 447 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDFY2Q96P53 400 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 BRD7Q9NPI1 651 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NDUFA7O95182 113 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSKH1P11801 424 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF20P17024 532 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF32P17041 273 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP5CP53041 499 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ODF4Q2M2E3 257 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR10A2Q9H208 303 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM206AQ9NX38 181 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 V9GY05 133 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 M0R135 149 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPRY3O43610 288 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 COX5BP10606 129 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms