RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5SQ99766 215 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NRIP2Q9BQI9 281 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HSPB9Q9BQS6 159 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TAPBPLQ9BX59 468 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PITPNM3Q9BZ71 974 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM234AQ9H0X4 552 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CDCP1Q9H5V8 836 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TUBA4BQ9H853 241 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 POLD4Q9HCU8 107 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MED29Q9NX70 200 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL12Q9NXK8 326 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IL36GQ9NZH8 169 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C1RLQ9NZP8 487 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 JKAMPQ9P055 326 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DOK5Q9P104 306 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRODH2Q9UF12 536 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRO0628Q9UI54 55 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ERG28Q9UKR5 140 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KCNS2Q9ULS6 477 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SLC45A2Q9UMX9 530 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ST3GAL6Q9Y274 331 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SNX10Q9Y5X0 201 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SCN4AP35499 1836 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KIF13AQ9H1H9 1805 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CUX1P39880 1505 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PALLDQ8WX93 1383 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KDM5CP41229 1560 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087WX48 190 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPK0 400 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM189A5PLL7 270 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5H1A6NKK0 313 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 YJEFN3A6XGL0 299 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 VWC2LB2RUY7 222 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM49D1C9J1S8 452 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LMO7DNF2Z398 122 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 H0YL77 283 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 J3QR06 171 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UPK1AO00322 258 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SOCS2O14508 198 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.62□□□□□ -1.992e-6■■■■□ 22.1
PTPRM-204ENST00000577468 XRCC3O43542 346 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HCRTR1O43613 425 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EML2O95834 649 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HPRT1P00492 218 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GCGP01275 180 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 AMBPP02760 352 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OPN1SWP03999 348 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 VTNP04004 478 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HPNP05981 417 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DBIP07108 87 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ADRA2AP08913 450 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM17P0DL12 118 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM225BP0DP42 221 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ESDP10768 282 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PSG1P11464 419 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HSD17B1P14061 328 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MYL12AP19105 171 aa2.62□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 LEPP41159 167 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NSG1P42857 185 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEA5P43359 124 aa2.62□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 RPL31P62899 125 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 DEFA5Q01523 94 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TGFBR3Q03167 851 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ST3GAL4Q11206 333 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF154Q13106 437 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R1AQ13522 171 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MELKQ14680 651 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GINS1Q14691 196 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HERPUD1Q15011 391 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PEA15Q15121 130 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TCTN1Q2MV58 587 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SNAI3Q3KNW1 292 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
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