RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNG2P59768 71 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEF2DQ14814 521 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM169BQ8N8A8 192 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAXEQ8NCW5 288 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q8NFD4 153 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR8S1Q8NH09 359 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 GIMAP1Q8WWP7 306 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST8SIA4Q92187 359 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OCSTAMPQ9BR26 566 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10A4Q9H209 315 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDH20Q9HBT6 801 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 FLVCR2Q9UPI3 526 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 MPC1Q9Y5U8 109 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SERPINE3A8MV23 424 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANGPTL7O43827 346 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMPD2O60906 423 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV1D-12P01611 117 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSTBP04080 98 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF735P0CB33 412 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CBX5P45973 191 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPA1Q15181 289 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 RTN4RL2Q86UN3 420 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SAXO1Q8IYX7 474 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5A2Q8NGI9 324 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51S1Q8NGJ8 323 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 HPSE2Q8WWQ2 592 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51J1Q9H342 316 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRIM1Q9NZV1 1036 aa24.44■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PR80 420 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSC22D1Q15714 1073 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 PECRQ9BY49 303 aa24.43■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SVILO95425 2214 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTR3BO95264 441 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL5P05113 134 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD276Q5ZPR3 534 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCTE3Q8IZS6 198 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SFXN3Q9BWM7 321 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC2A8Q9NY64 477 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSF4Q9ULV5 492 aa24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLV1-44P01699 117 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 GVQW1Q8N7I0 195 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 MED28Q9H204 178 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFT46Q9NQC8 304 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP1CBP62140 327 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZMYND11Q15326 602 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL11BQ5VVY1 283 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM200AQ86VY9 491 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 CALHM1Q8IU99 346 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPRMLQ8N4K4 120 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51F2Q8NH61 342 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 GINS4Q9BRT9 223 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMDHD2Q9Y303 409 aa24.41■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TUBG1P23258 451 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF611Q8N823 705 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4S1Q8NGB4 309 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5P3Q8WZ94 311 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 TUBG2Q9NRH3 451 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5H1A6NKK0 313 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCER2P06734 321 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF35P13682 527 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 UCP2P55851 309 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSR2Q8N2R0 312 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa24.39■■□□□ 1.5
CTDNEP1-210ENST00000574322 DISC1C4P0D8 188 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 M0QYG6 137 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLATP00750 562 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMY2AP04746 511 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAC2P15153 192 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SIGIRRQ6IA17 410 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELP2Q6IA86 826 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BPIFB2Q8N4F0 458 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ING3Q9NXR8 418 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5B21A6NL26 309 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 A8MV72 311 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms