RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.035e-8■□□□□ 9.7
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMCX4Q5H9R4 360 aa27.69■■■□□ 2.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPX5O75715 221 aa27.68■■■□□ 2.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXJ3Q9UPW0 622 aa27.67■■■□□ 2.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIN1P1O15428 100 aa27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 BDKRB2P30411 391 aa27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK11-1P61568 191 aa27.65■■■□□ 2.02
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