RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5B21A6NL26 309 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CA11O75493 328 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFB6O95139 128 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB3DO95716 219 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1D-12P01611 117 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBX5P45973 191 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPM6AP51674 278 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CALHM1Q8IU99 346 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OSR2Q8N2R0 312 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PECRQ9BY49 303 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPINE3A8MV23 424 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF732B4DXR9 585 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1QTNF9P0C862 333 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPA1Q15181 289 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC120Q96HB5 630 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCL2L14Q9BZR8 327 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAMA5O15230 3695 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 C7orf66A4D0T2 115 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 A8MXE2 369 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SSX5O60225 188 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PEX14O75381 377 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLRB1Q12918 225 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEF2DQ14814 521 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 C3orf36Q3SXR2 165 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4D10Q8NGI6 311 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 TINAGQ9UJW2 476 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 FCER2P06734 321 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRR1P24046 479 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 HAAOP46952 286 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARFRP1Q13795 201 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A26Q70HW3 274 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRGPRGQ86SM5 289 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM200AQ86VY9 491 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST8SIA4Q92187 359 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100PBPQ96BU1 408 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANAPC10Q9UM13 185 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0G2JNJ9 132 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAF2O60831 178 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBPP20226 339 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMP5P22003 454 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNG3P63215 75 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 MKXQ8IYA7 352 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q8NFD4 153 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OCSTAMPQ9BR26 566 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q9UFV3 132 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSF4Q9ULV5 492 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0A6YYJ9 748 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 IQCF6A8MYZ5 107 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTN4RL2Q86UN3 420 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51S1Q8NGJ8 323 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 MUCL1Q96DR8 90 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR10A4Q9H209 315 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 LILRA1O75019 489 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SFTPBP07988 381 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAT1P18440 290 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 CA6P23280 308 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVS71-1P61550 626 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF573Q86YE8 665 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 GVQW1Q8N7I0 195 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6F1Q8NGZ6 308 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 GHITMQ9H3K2 345 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 DISC1C4P0D8 188 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF9Q16594 264 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELP2Q6IA86 826 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 GIMAP1Q8WWP7 306 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 MICU1Q9BPX6 476 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 GINS4Q9BRT9 223 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST3GAL6Q9Y274 331 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMY2AP04746 511 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 MECP2P51608 486 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXL14Q8N1E6 418 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4S1Q8NGB4 309 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTL8AQ9BWD3 113 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms