RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ATP6V1B1P15313 513 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CAPGP40121 348 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KIR3DL2P43630 455 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GPM6AP51674 278 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 CDONQ4KMG0 1287 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KLHL22Q53GT1 634 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 WDR82Q6UXN9 313 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 DOK3Q7L591 496 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 LRRC29Q8WV35 223 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 SEH1LQ96EE3 360 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ALG8Q9BVK2 526 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 GPR173Q9NS66 373 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 V9GYS6 101 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GVI7 797 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 H0YAE9 185 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 LGALS8O00214 317 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 LHBP01229 141 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GYPAP02724 150 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 HTR1AP08908 422 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SCAND1P57086 179 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RAB40BQ12829 278 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ZNF404Q494X3 552 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SETD9Q8NE22 299 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR5T2Q8NGG2 359 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PELI1Q96FA3 418 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ZNF649Q9BS31 505 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 VCXQ9H320 206 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ABCB9Q9NP78 766 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 MMP26Q9NRE1 261 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 MIOXQ9UGB7 285 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OOEPA6NGQ2 149 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TMEM210A6NLX4 147 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 E9PI62 339 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TRIM77I1YAP6 450 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 AKR7A2O43488 359 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FOXH1O75593 365 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RHBDL1O75783 438 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 LIMS3P0CW19 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 LIMS4P0CW20 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CCL1P22362 96 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ETV1P50549 477 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ACTA2P62736 377 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GNB2P62879 340 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GNG3P63215 75 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ACTG2P63267 376 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 IL18R1Q13478 541 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ESCO2Q56NI9 601 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 Q6ZSR3 168 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 KRT74Q7RTS7 529 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RNF141Q8WVD5 230 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TFAP2CQ92754 450 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GGHQ92820 318 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR8B2Q96RD0 313 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 OR51I2Q9H344 312 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-217ENST00000550044 RYR3Q15413 4870 aa8□□□□□ -1.13
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