RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540191.1

KDM2B-211, Transcript of lysine demethylase 2B, humanhuman

TSL 4

Gene KDM2B, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2B-211ENST00000540191 TMEM42Q69YG0 159 aa7.56□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 H3BUX3 64 aa7.55□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 ACSM1Q08AH1 577 aa7.55□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.55□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 Q6ZSR3 168 aa7.55□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 OR5R1Q8NH85 324 aa7.55□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 H0YAE9 185 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 CCL1P22362 96 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 MPZP25189 248 aa7.54□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 CAPZA1P52907 286 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 EGR3Q06889 387 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 BLMHQ13867 455 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 ZNF273Q14593 569 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.54□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 ZNF573Q86YE8 665 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 CALHM1Q8IU99 346 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 MKXQ8IYA7 352 aa7.54□□□□□ -1.2
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KDM2B-211ENST00000540191 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.53□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.53□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 G3V2T6 193 aa7.53□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 H3BSH0 61 aa7.53□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 SLC1A7O00341 560 aa7.53□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 DLGAP1O14490 977 aa7.53□□□□□ -1.2
KDM2B-211ENST00000540191 DYNC1I1O14576 645 aa7.53□□□□□ -1.2
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