RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISOC1Q96CN7 298 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STARD4Q96DR4 205 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMIM19Q96E16 107 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF125Q96EQ8 232 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCTD7Q96MP8 289 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF649Q9BS31 505 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPPP3Q9BW30 176 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR10A2Q9H208 303 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR52A1Q9UKL2 312 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BSNQ9UPA5 3926 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACNA1BQ00975 2339 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.88□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GVI7 797 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM238C9JI98 176 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0R135 149 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F2RL2O00254 374 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDCD5O14737 125 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAD51DO75771 328 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABHD16AO95870 558 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCER2P06734 321 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADRA2AP08913 450 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OCM2P0CE71 109 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNOP22674 350 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV1-2P23083 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OPRL1P41146 370 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST1H3AP68431 136 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSG4Q00888 419 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAMTQ14353 236 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM189A2Q15884 450 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DGUOKQ16854 277 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D28Q2M2D7 210 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF684Q5T5D7 378 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF774Q6NX45 483 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DRAM2Q6UX65 266 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF485Q8NCK3 441 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR148Q8TDV2 347 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHYHIPQ92561 330 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GHSRQ92847 366 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO17Q96EF6 278 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF799Q96GE5 643 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA25Q9BR10 227 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR51E2Q9H255 320 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VCX2Q9H322 139 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDH20Q9HBT6 801 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CKLFQ9UBR5 152 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAGKQ9UJ70 344 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DHDHQ9UQ10 334 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNK7Q9Y2U2 307 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEMO1Q9Y316 297 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STARD10Q9Y365 291 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTTNQ86VV8 2226 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATMQ13315 3056 aa4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0G2JNJ9 132 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F8WDY8 70 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GABRPO00591 440 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASKO14936 926 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYT7O43581 403 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYNGR3O43761 229 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNFSF13O75888 250 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOXO94900 526 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NXPH2O95156 264 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GABARAPO95166 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LALBAP00709 142 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms