RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 C4orf45Q96LM5 186 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 DDOQ99489 341 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF649Q9BS31 505 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OPN4Q9UHM6 478 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RCE1Q9Y256 329 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 J3QRE1 110 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF208O43345 1280 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 YIF1AO95070 293 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CYC1P08574 325 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CD82P27701 267 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FAM57BQ71RH2 274 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 BEST3Q8N1M1 668 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MALSU1Q96EH3 234 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OXGR1Q96P68 337 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SPACA5Q96QH8 159 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UCN2Q96RP3 112 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 APC2O95996 2303 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MED13Q9UHV7 2174 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PRR32B1ATL7 298 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A18H0YCH9 400 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RER1O15258 196 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SC5DO75845 299 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TXNDC12O95881 172 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ITGA5P08648 1049 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RAG2P55895 527 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V1FQ16864 119 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR10K2Q6IF99 312 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 VWA1Q6PCB0 445 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MOB3CQ70IA8 216 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ASB10Q8WXI3 467 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RAMP1O60894 148 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CTAG2O75638 210 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NFYBP25208 207 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR3A1P47881 315 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 S100A7AQ86SG5 101 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SIAH3Q8IW03 269 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM104Q8NE00 496 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB124Q8NES8 71 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CHIAQ9BZP6 476 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ARL6Q9H0F7 186 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RASL12Q9NYN1 266 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 HMSDA8MTL9 139 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PHOX2AO14813 284 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2F2P13984 249 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ADCYAP1P18509 176 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GABRR1P24046 479 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GLP1RP43220 463 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ARG2P78540 354 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SCGB2A2Q13296 93 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 AAED1Q7RTV5 226 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 M1APQ8TC57 530 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR10A4Q9H209 315 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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