RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.78□□□□□ -0.84
CNOT4-211ENST00000498534 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.78□□□□□ -0.84
CNOT4-211ENST00000498534 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.78□□□□□ -0.84
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF222Q9UK12 451 aa9.78□□□□□ -0.84
CNOT4-211ENST00000498534 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.78□□□□□ -0.84
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF254O75437 659 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 NRASP01111 189 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 OSMP13725 252 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 HCCSP53701 268 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ERVFRD-1P60508 538 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 MS4A2Q01362 244 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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CNOT4-211ENST00000498534 ZNF573Q86YE8 665 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CALHM1Q8IU99 346 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 POC1AQ8NBT0 407 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.77□□□□□ -0.85
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CNOT4-211ENST00000498534 GPR84Q9NQS5 396 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 USE1Q9NZ43 259 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PLXNB1O43157 2135 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.77□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 H3BUI4 141 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PSMD9O00233 223 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 XPNPEP2O43895 674 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PEX14O75381 377 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 E2F6O75461 281 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 NXPH2O95156 264 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 COX7A1P24310 79 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PAX6P26367 422 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 HAAOP46952 286 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ACTR3P61158 418 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CDK5Q00535 292 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 APOFQ13790 326 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CD177Q8N6Q3 437 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 TEAD3Q99594 435 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 FAM206AQ9NX38 181 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.76□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 VGLL3A8MV65 326 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 FBXO24O75426 580 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ALX3O95076 343 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PGA5P0DJD9 388 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ANXA8P13928 327 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 FAHP16930 419 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 BMXP51813 675 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ESRRGP62508 458 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 GNGT1P63211 74 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ROM1Q03395 351 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 SNAPC1Q16533 368 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PIFOQ8TCI5 191 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ASB9Q96DX5 294 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 MALSU1Q96EH3 234 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF488Q96MN9 340 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.75□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 J3QT63 122 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 DLGAP1O14490 977 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PIN1P1O15428 100 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CHST1O43916 411 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 DHRS3O75911 302 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 TK1P04183 234 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 CCL3L1P16619 93 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 SLC2A5P22732 501 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 RAB13P51153 203 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.74□□□□□ -0.85
CNOT4-211ENST00000498534 ASRGL1Q7L266 308 aa9.74□□□□□ -0.85
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