RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GDF1P27539 372 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1C1Q04828 323 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 P2RY6Q15077 328 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF13Q15543 124 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM225Q6GV28 225 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RPTNQ6XPR3 784 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMKLAQ8IXN7 391 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35G3Q8N808 338 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF649Q9BS31 505 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 NELFAQ9H3P2 528 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF212BA8MTL3 300 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 G3V3Q6 166 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MT-ND4P03905 459 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ESDP10768 282 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HSD17B1P14061 328 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 NSG1P42857 185 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 DNASE1L1P49184 302 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT2P50583 147 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PAFAH1B2P68402 229 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HIF1AQ16665 826 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL9Q3SXZ7 439 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 UTF1Q5T230 341 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CPTPQ5TA50 214 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR7G2Q8NG99 324 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM163Q8TC26 289 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ISOC2Q96AB3 205 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 EID2BQ96D98 161 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 LAT2Q9GZY6 243 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MYLKQ15746 1914 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPRSS11DO60235 418 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TOXO94900 526 aa4.01□□□□□ -1.77
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RABGGTB-213ENST00000496055 BMP5P22003 454 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CMPK1P30085 196 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB8AP61006 207 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MRGPREQ86SM8 312 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 STPG4Q8N801 248 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ELOA3Q8NG57 546 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MRAPQ8TCY5 172 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10C1Q96KK4 312 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP3Q96NJ6 502 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR76Q9H967 626 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 C7orf66A4D0T2 115 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 K7EN84 100 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 HSD17B6O14756 317 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 CTDSPLO15194 276 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PTGER1P34995 402 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 AVPR1BP47901 424 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 UQCRFS1P47985 274 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MTNR1BP49286 362 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PIGPP57054 158 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GFRALQ6UXV0 394 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 MOB3CQ70IA8 216 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4□□□□□ -1.77
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