RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 MALLQ13021 153 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 IRF3Q14653 427 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR8B8Q15620 311 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 TIGD6Q17RP2 521 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 FDX2Q6P4F2 183 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 Q6ZSR3 168 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR5AS1Q8N127 324 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CHIAQ9BZP6 476 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR10A2Q9H208 303 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 GPR84Q9NQS5 396 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 AUP1Q9Y679 476 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 PTGES3LE9PB15 166 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 P2RY10O00398 339 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MT-ND5P03915 603 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ADH4P08319 380 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CCL1P22362 96 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ACTA2P62736 377 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ACTG2P63267 376 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CSNK2BP67870 215 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ODF4Q2M2E3 257 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 RNLSQ5VYX0 342 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 RDH10Q8IZV5 341 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 STX19Q8N4C7 294 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR8G5Q8NG78 346 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR52N1Q8NH53 320 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OPA3Q9H6K4 179 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SP140LQ9H930 580 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 SCN3BQ9NY72 215 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC42Q9Y546 428 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 V9GYS6 101 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 PLSCR5A0PG75 271 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 GGT3PA6NGU5 568 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 H3BSH0 61 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OGG1O15527 345 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 FOXH1O75593 365 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MT-ND2P03891 347 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 HLA-DPB1P04440 258 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ISG15P05161 165 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CD55P08174 381 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF12P17014 697 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MYL12AP19105 171 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CA6P23280 308 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 LIPAP38571 399 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 TGM4P49221 684 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 CCR9P51686 369 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF154Q13106 437 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MED21Q13503 144 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 PDCD1Q15116 288 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MOGQ16653 247 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 KRT74Q7RTS7 529 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 KLBQ86Z14 1044 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 MYDGFQ969H8 173 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 OR5M11Q96RB7 305 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf135-204ENST00000495399 TBX15Q96SF7 602 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms