RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-213ENST00000492657 PRSS44E7EML9 344 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 F5H0A9 414 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-213ENST00000492657 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-213ENST00000492657 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SERPINA7P05543 415 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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PRAME-213ENST00000492657 AGPAT2O15120 278 aa11.2□□□□□ -0.62
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PRAME-213ENST00000492657 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PSG4Q00888 419 aa11.2□□□□□ -0.62
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