RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MAP6Q96JE9 813 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C2orf50Q96LR7 162 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ACSM4P0C7M7 580 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FAM122BQ7Z309 247 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ST8SIA4Q92187 359 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CCL17Q92583 94 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TAAR5O14804 337 aa11.86□□□□□ -0.51
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HDLBP-241ENST00000487169 GABRA1P14867 456 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FCARP24071 287 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZXDAP98168 799 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TPPP3Q9BW30 176 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NOTCH2Q04721 2471 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PSME4Q14997 1843 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR13C7P0DN81 318 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB25P24278 435 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CSRP3P50461 194 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SKP2Q13309 424 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CDH26Q8IXH8 852 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 BAP18Q8IXM2 172 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf40Q8IXQ3 194 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.86□□□□□ -0.51
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HDLBP-241ENST00000487169 UCN2Q96RP3 112 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SEMG1P04279 462 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CD80P33681 288 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SELENOPP49908 381 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SSTP61278 116 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 HMGN3Q15651 99 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC10Q5BKY1 277 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MESTQ5EB52 335 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 DHRS9Q9BPW9 319 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GNB4Q9HAV0 340 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 M0R1X1 148 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GPR31O00270 319 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GP1BAP07359 652 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CBR1P16152 277 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GINS3Q9BRX5 216 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PIGMQ9H3S5 423 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 AK3Q9UIJ7 227 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TXNL1O43396 289 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NME2P1O60361 137 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MT-ND4LP03901 98 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SLC25A45Q8N413 288 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ABHD3Q8WU67 409 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 WDR54Q9H977 334 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MED9Q9NWA0 146 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-241ENST00000487169 MED13LQ71F56 2210 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GPR37O15354 613 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR10J4P0C629 311 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ARID2Q68CP9 1835 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C3orf80F5H4A9 247 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 AKR7A2O43488 359 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PDCD6O75340 191 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 DTYMKP23919 212 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CORO2AQ92828 525 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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