RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468284.1

CKAP2-205, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene CKAP2, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-205ENST00000468284 ALG12Q9BV10 488 aa7□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 HCAR1Q9BXC0 346 aa7□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF391Q9UJN7 358 aa7□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SNX13Q9Y5W8 968 aa7□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SERPINA1P01009 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 CTLA4P16410 223 aa6.99□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 NDUFB7P17568 137 aa6.99□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.99□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 ETAA1Q9NY74 926 aa6.99□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.99□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 CD300LBA8K4G0 201 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF785A8K8V0 405 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 RHBDL1O75783 438 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 NXPH3O95157 252 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 MT-ND1P03886 318 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 CD24P25063 80 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 POU1F1P28069 291 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 MYCNOSP40205 109 aa6.98□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 AQP6Q13520 282 aa6.98□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 MEP1BQ16820 701 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.98□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.98□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 FAM162AQ96A26 154 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SGTBQ96EQ0 304 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.98□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZNF682O95780 498 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SEMG1P04279 462 aa6.97□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 CCL3L1P16619 93 aa6.97□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 OR1E2P47887 323 aa6.97□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 SELENOWP63302 87 aa6.97□□□□□ -1.29
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CKAP2-205ENST00000468284 FLOT2Q14254 428 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 DEFB136Q30KP8 78 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 WDR82Q6UXN9 313 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 PGAP1Q75T13 922 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.97□□□□□ -1.29
CKAP2-205ENST00000468284 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.97□□□□□ -1.29
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