RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 UNC119Q13432 240 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM16LQ309B1 348 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 FAM209AQ5JX71 171 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZTK2 550 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 OSR2Q8N2R0 312 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 POC5Q8NA72 575 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 ERGIC1Q969X5 290 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 RAB3CQ96E17 227 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 OR51I2Q9H344 312 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 POFUT1Q9H488 388 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 COPZ2Q9P299 210 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HDLBP-211ENST00000425989 HCFC1P51610 2035 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 DPRXA6NFQ7 191 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 J3QT63 122 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ORC5O43913 435 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 GOSR1O95249 250 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 HTR3BO95264 441 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 MPIG6BO95866 241 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 THBDP07204 575 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CD3EP07766 207 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CSF1P09603 554 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 TNFSF4P23510 183 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CFHR2P36980 270 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 HAAOP46952 286 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 GPM6AP51674 278 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 EFNB2P52799 333 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 IFITM3Q01628 133 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 OXA1LQ15070 435 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 MPV17LQ2QL34 196 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CDNFQ49AH0 187 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 BEX5Q5H9J7 111 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A25Q6T423 547 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF611Q8N823 705 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CHST4Q8NCG5 386 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 AQP3Q92482 292 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 YIPF5Q969M3 257 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SPACA5Q96QH8 159 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 OR51B6Q9H340 312 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 RASL12Q9NYN1 266 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 GLS2Q9UI32 602 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ATMQ13315 3056 aa8.21□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CADP27708 2225 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQ09 198 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 LPLP06858 475 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 ADH4P08319 380 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 FUT3P21217 361 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 MPV17P39210 176 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 CD200P41217 278 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 VEGFCP49767 419 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 FGF12P61328 243 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 TLE1Q04724 770 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 IL13RA2Q14627 380 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZNX1 250 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 GPX8Q8TED1 209 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 Q96M66 194 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.2□□□□□ -1.1
HDLBP-211ENST00000425989 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms