RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GK3PQ14409 553 aa10.61□□□□□ -0.71
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCN8Q6JVE9 175 aa10.61□□□□□ -0.71
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEVQ99581 238 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR84Q9NQS5 396 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGLQ9Y2B2 252 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARRDC5A6NEK1 342 aa10.61□□□□□ -0.71
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS3O75911 302 aa10.61□□□□□ -0.71
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