RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 GHRLQ9UBU3 117 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 MEMO1Q9Y316 297 aa16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINE3A8MV23 424 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM8Q96KF7 97 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF708P17019 499 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CPT2P23786 658 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NELFAQ9H3P2 528 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV3-1P01715 115 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ID4P47928 161 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CAV2P51636 162 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FADS6Q8N9I5 356 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST5Q9GZS9 411 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 V9GYS6 101 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSSP25774 331 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH3B1P43353 468 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SPEM2Q0P670 501 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CHAF1BQ13112 559 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SULF2Q8IWU5 870 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 HAS2Q92819 552 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 UCN2Q96RP3 112 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGQQ9BRB3 760 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TM2D1Q9BX74 207 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR173Q9NS66 373 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0U1RQV5 110 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF205O95201 554 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS12P56730 875 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FNDC9Q8TBE3 224 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PP6455Q8WZ26 134 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC6Q6W4X9 2439 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 G3V3Y1 287 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EPK0 472 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R135 149 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 DKK1O94907 266 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SCGB1D2O95969 90 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM225BP0DP42 221 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF799Q96GE5 643 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 GNRHR2Q96P88 292 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGPTL7O43827 346 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SFTA3P0C7M3 94 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ADH6P28332 368 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PDZK1IP1Q13113 114 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NABP1Q96AH0 204 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP57Q9NU63 452 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF581Q9P0T4 197 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL17Q9UF56 701 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF292O60281 2723 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPA2E9PIF3 369 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPA3F8WFD2 350 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TAAR5O14804 337 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FCGR2CP31995 323 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CD80P33681 288 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB13P51153 203 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RRADP55042 308 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RAET1LQ5VY80 246 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM186AA6NE01 2351 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TP53I11O14683 189 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RFC3P40938 356 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 H3F3AP84243 136 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms