RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 OR3A2P47893 321 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MTPNP58546 118 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SRPXP78539 464 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 EFNB1P98172 346 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TCTN1Q2MV58 587 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF429Q86V71 674 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NRTNQ99748 197 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SGK2Q9HBY8 427 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ENY2Q9NPA8 101 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXL17Q9UF56 701 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NIN4 97 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R129 80 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GNGT2O14610 69 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OPN1SWP03999 348 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYGBP07316 175 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MGMTP16455 207 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR1FP30939 366 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SOAT1P35610 550 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 UQCRFS1P47985 274 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 UPP1Q16831 310 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 BAALCQ8WXS3 180 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GGHQ92820 318 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MUCL1Q96DR8 90 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 COPS8Q99627 209 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51F1A6NGY5 319 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BQ15 152 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1F1O43749 312 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM78BQ5VT40 261 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4A5Q8NH83 315 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RERGLQ9H628 205 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NINQ8N4C6 2090 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GW64 132 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PRU2 124 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF16O43320 207 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 C1RP00736 705 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10J1P30954 320 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PYCR1P32322 319 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 BSGP35613 385 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NPBWR2P48146 333 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 H2BFSP57053 126 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRPAP78324 504 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP1Q07960 439 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ELOBQ15370 118 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CHST4Q8NCG5 386 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC22AQ96IW7 307 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MMP26Q9NRE1 261 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RARRES3Q9UL19 164 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NME7Q9Y5B8 376 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PR80 420 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GFRA2O00451 464 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DIRAS1O95057 198 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4Q2P0C623 313 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CX3CR1P49238 355 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RAP2BP61225 183 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS2Q13268 280 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PNKDQ8N490 385 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR82Q96P67 336 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 POMKQ9H5K3 350 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms