RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 MT-ND2P03891 347 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 GLRA1P23415 457 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RBP2P50120 134 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NPY4RP50391 375 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 MTCP1P56278 107 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 GNB2P62879 340 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LCN2P80188 198 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 BDH1Q02338 343 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM90A1Q86YD7 464 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51A4Q8NGJ6 313 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10AC1Q8NH08 325 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NPRL2Q8WTW4 380 aa12.86□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMIGD2Q96BF3 282 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 BEX2Q9BXY8 128 aa12.86□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.86□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 RHBDL1O75783 438 aa12.85□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 CRHBPP24387 322 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 MPZP25189 248 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 IL24Q13007 206 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SPHARQ15513 63 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CR1LQ2VPA4 569 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM21Q3B7S5 101 aa12.85□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 CD276Q5ZPR3 534 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 XAF1Q6GPH4 301 aa12.85□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.85□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 MED30Q96HR3 178 aa12.85□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.84□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ANGPTL5Q86XS5 388 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR13C9Q8NGT0 318 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OPALINQ96PE5 141 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.84□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NLKQ9UBE8 527 aa12.84□□□□□ -0.35
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR2AT4A6NND4 320 aa12.83□□□□□ -0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 SULT1B1O43704 296 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 NXPH2O95156 264 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 LALBAP00709 142 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PGA5P0DJD9 388 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 CELP19835 753 aa12.83□□□□□ -0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 SOX2P48431 317 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP3R1P63098 170 aa12.83□□□□□ -0.36
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS48Q7RTY5 328 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8IYB0 196 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP19Q96LK0 163 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 MDFIQ99750 246 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 CKLFQ9UBR5 152 aa12.83□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC105371242A0A075B767 164 aa12.82□□□□□ -0.36
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa12.82□□□□□ -0.36
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