RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 LYZL2Q7Z4W2 148 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LUZP2Q86TE4 346 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q8NAQ8 132 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF555Q8NEP9 628 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR52E5Q8NH55 327 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM81AQ8TBF8 368 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 BAALCQ8WXS3 180 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5P3Q8WZ94 311 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAD51AP1Q96B01 352 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PYURFQ96I23 114 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPP1R36Q96LQ0 422 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 DERL3Q96Q80 235 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIB3Q96RU7 358 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 THTPAQ9BU02 230 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 DEFB129Q9H1M3 183 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 VAX2Q9UIW0 290 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 DDX19BQ9UMR2 479 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF337Q9Y3M9 751 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 FADS3Q9Y5Q0 445 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ELP1O95163 1332 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 MIA3Q5JRA6 1907 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 STRCP1A6NGW2 1772 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 G3V3Q6 166 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LY6LH3BQJ8 138 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZBTB5O15062 677 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC37A4O43826 429 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC19A2O60779 497 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRPS1L1P21108 318 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSMB2P49721 201 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLDN6P56747 220 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 DNAJC3Q13217 504 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ALKBH6Q3KRA9 238 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCTD16Q68DU8 428 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM231DQ6ZW35 169 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LYPD6Q86Y78 171 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 AMN1Q8IY45 258 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF738Q8NE65 137 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR8K1Q8NGG5 319 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZFAND1Q8TCF1 268 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2E2Q96LR5 201 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCGB3A2Q96PL1 93 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARV1Q9H2C2 271 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ELOVL6Q9H5J4 265 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 AUNIPQ9H7T9 357 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYP3A43Q9HB55 503 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RHOFQ9HBH0 211 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 BEX1Q9HBH7 125 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM38BQ9NVV0 291 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 NMRK1Q9NWW6 199 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 GCNT4Q9P109 453 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAC3Q9UHF0 121 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPIL1Q9Y3C6 166 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ICOSQ9Y6W8 199 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ENPP4Q9Y6X5 453 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 CR1P17927 2039 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 INSRP06213 1382 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 AK9Q5TCS8 1911 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 MPDZO75970 2070 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATG2BQ96BY7 2078 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 DOCK10Q96BY6 2186 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A075B6Q4 140 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC169A6NNP5 214 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 K7ERS5 55 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 P01737 135 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 OPN1SWP03999 348 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 SEC11BP0C7V7 166 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 MLNP12872 115 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 MTPNP58546 118 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC35A1P78382 337 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITIH4Q14624 930 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ELOCQ15369 112 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 GABRA6Q16445 453 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM53Q6P2H8 277 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF767PQ75MW2 155 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM122BQ7Z309 247 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM25Q86YD3 366 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITPRIPQ8IWB1 547 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM234Q8WY98 164 aa0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms