RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 C7orf66A4D0T2 115 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 OTX2P32243 289 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 OR52B4Q8NGK2 314 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 TREM2Q9NZC2 230 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 THYN1Q9P016 225 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-202ENST00000334414 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRB-202ENST00000334414 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.96□□□□□ -1.61
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PTPRB-202ENST00000334414 OR8B3Q8NGG8 313 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 GFYI3L273 518 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 SOD3P08294 240 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 EDDM3BP56851 147 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF273Q14593 569 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 IFITM10A6NMD0 228 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 GHRHP01286 108 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 HBZP02008 142 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 FITM1A5D6W6 292 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 MS4A18H0YCH9 400 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ABOP16442 354 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 EPHA2P29317 976 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 CTSCP53634 463 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 MS4A18Q3C1V0 323 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 OR1P1Q8NH06 330 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 IL22RA2Q969J5 263 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 POM121Q96HA1 1249 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 STARD10Q9Y365 291 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 A0A1W2PNV4 684 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 SCRG1O75711 98 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 DAOP14920 347 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 IRS1P35568 1242 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 USP53Q70EK8 1073 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 D2HGDHQ8N465 521 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 NPIPB9F8W1W9 429 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 KMT5CQ86Y97 462 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 PTOV1Q86YD1 416 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 DERL3Q96Q80 235 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 RNF167Q9H6Y7 350 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 MYO10Q9HD67 2058 aa4.96□□□□□ -1.62
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