RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ANXA3P12429 323 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 GPM6AP51674 278 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 PER3P56645 1201 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 IFITM2Q01629 132 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 MICBQ29980 383 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 LIX1LQ8IVB5 337 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 BATF2Q8N1L9 274 aa15.39■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.38■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 OPA3Q9H6K4 179 aa15.37■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CDH20Q9HBT6 801 aa15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 HOGA1Q86XE5 327 aa15.37■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 EXTL1Q92935 676 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 SLAMF9Q96A28 289 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.35■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 NPTNQ9Y639 398 aa15.35■□□□□ 0.05
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