RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 ZNF124Q15973 351 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 THEM4Q5T1C6 240 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TMEM234Q8WY98 164 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ST8SIA1Q92185 356 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CYYR1Q96J86 154 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 C18orf12Q96KH6 178 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 NAA60Q9H7X0 242 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CHST11Q9NPF2 352 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR5H15A6NDH6 313 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR5H1A6NKK0 313 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 B4DEV8 164 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LY86O95711 162 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 IGLV3-1P01715 115 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HEXBP07686 556 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 DUSP1P28562 367 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 GLIPR1P48060 266 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LCN10Q6JVE6 187 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR5R1Q8NH85 324 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RARRES2Q99969 163 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SYT3Q9BQG1 590 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 NELFAQ9H3P2 528 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 IL23AQ9NPF7 189 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HSF4Q9ULV5 492 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.88□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ARID1AO14497 2285 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GV90 55 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 C10orf142B7Z368 130 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TSTD3H0UI37 97 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ST8SIA3O43173 380 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SOD3P08294 240 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CXCL1P09341 107 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CTSSP25774 331 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 AKT2P31751 481 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ERVFRD-1P60508 538 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF266Q14584 549 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 KISS1Q15726 138 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 KCNMB1Q16558 191 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 KHDC3LQ587J8 217 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZSR3 168 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZSR6 202 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 YAF2Q8IY57 180 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 GPER1Q99527 375 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PIGQQ9BRB3 760 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SOX7Q9BT81 388 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 MED29Q9NX70 200 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.87□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SCGB1D2O95969 90 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SERPINA2P20848 420 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PIGPP57054 158 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RAB4BP61018 213 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 UBE2KP61086 200 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RND3P61587 244 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 DLK1P80370 383 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms